游离氯的杀菌主要原理是强氧化性的HClO、ClO-侵入细菌体内，到达细菌内部，并其氧化作用，破坏细菌酶系统来达到杀死细菌的目的，化合性余氯的氧化能力相对较弱，杀菌速度不及游离性余氯，但提高化合性余氯的浓度或延长杀菌时间。
三、自来水中为什么会有余氯？
自来水在供水管网也受到会环境的污染，导致水中的细菌等有害微生物快速繁殖，
为了要抑制和杀灭水中的细菌供水企业一般通过增加出厂水投氯量来保证管网末梢的余氯但前端过量余氯也会产生气味。
四、余氯、总氯、有效氯如何检测？
目前市上余氯、总氯、有效氯的检测方法多样，有试剂耗材类的也有水质检测分析仪器类，世界耗材如广东环凯生物技术快检试纸、试剂，体积小，检测便捷，基于国家标准法，检测结果可靠、精确，适用于现场和实验室快速检测。如余氯测定试纸(0-20mg/L)、总氯测定试剂盒（0.1-10mg/L）、有效氯检测试纸（0-5000mg/L)等等多种高低量程检测试纸试剂仪器。
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